[Shadow]

Троит если - должен выдавать Misfire, на какие то конкретные цилиндры, либо на случайный.
У тебя GT или GTS?

С чего ты взял что в норме, ты нашёл какие то конкретные показания, или электрик сказал?
Провода ВВ проверяли сопротивление? Они запросто могут вызывать такое.
В смысле наверное бегунок тебе заменили в сборе?

EGR тебе может давать в заклинившем состоянии (если в открытом) то тряску на двигатель в диапазоне во всём, если наоборот (не открывается), то в какие то моменты холостой ход будет неожиданно подниматься вверх, и держаться какое то время, потом падать.
Был бы в Москве - помог бы вырубить его целиком через прошивку, если есть кабель OpenPort 1.3U - то обращайся, могу сделать прошивку без ЕГР.

Добавлено через 15 минут
Кстати говоря, после чего началось то?
Свечки или ещё чего до этого не меняли?

На крышке написаны номера вот провода нужно так соединить с цилиндрами, чтобы 6 к 6 был, 5 к 5 и т.д.:
Если на блок открыв капот сверху:
1 3 5
2 4 6


Если замена свечей усугубила ситуацию - возможно скорее всего дело как раз таки в проводах, т.к. лиший раз их дёргать - это возможно где то ещё сильнее убило контакт, и теперь вообще искры почти нету на какой то цилиндр, либо вообще нету.
P.S. лямбды смотрели? что выдают? что с чистками всякими, форсы мыли? каналы в коллекторе впускном чистили? дроссель?